Территориальная организация транспорта регионов России отличается чрезвычайной сложностью, что обусловлено следующими причинами: ее огромная территория; самая большая, по сравнению с другими государствами, протяженность с востока на запад; очень сложный территориальный состав административных единиц с их органами власти; очень “пестры” национальный состав России; республики, округа, автономные области различны по размерам и конфигурации территории, экономическому и ресурсному потенциалу; основные ядрообразующие региональные системы государства находятся возле западных границ России, а природные ресурсы – на востоке; некоторые участки единой транспортной системы России оказались на территории других государств в результате распада СССР; часть магистралей железнодорожных, автомобильных, морских и речных находятся на территории Казахстана, Украины и другие государств.