В Гобустане имеется несколько эпицентров землетрясений, сила которых оценивается в 8-9 баллов по шкале Рихтера. Наибольшая интенсивность землетрясений отмечается, как известно, в зонах крупных разломов. Такими разломами (Аджичай-Алятский и др.) в Гобустане осложнен ряд антиклинальных структур, лежащих на пути трассы (Алятская гряда, Тоурогай-Кянизадаг-Сангачал-море и т. д.). Основная опасность, представляемая в период активизации разлома, заключается в его способности нанести серьезные повреждения конструкции трубопроводов вследствие ее деформации или разрыва, связанного с разрывами и прогибаниями грунта.